如今，計算機系統被廣泛應用于中小農業企業的生產經營中去。常見的應用于中小農業企業的計算機系統包括以下幾種：
第一、中小農業企業財務管理計算機系統
該項系統借助于計算機系統以及相關的財務軟件，實現中小農業企業財務管理的功能。包括會計憑證的審核，錄入，匯總，編制等等，同時將中小農業企業的財務管理系統與其他計算機管理系統實現無縫對接，有效地對中小農業企業實現全面管理。
第二、中小農業企業進銷存管理信息系統
該項系統依賴于成熟的計算機軟件以及電子信息化管理系統，實現包括進貨管理，銷售統計，倉庫管理的功能，能夠幫助中小農業企業了解自身經營狀況，實現企業內部成本核算與管控的功能，能夠最大化倉庫使用價值。
第三、中小農業企業人事管理信息系統
中小農業企業人事管理信息系統主要通過計算機軟件以及常用的無線設備，實現企業內部人員管理，人事招錄，內部文件共享的功能。中小農業企業為了尋求更為寬廣的發展，必須實現高效的人事管理系統，這時候一套運行良好，性能穩定的計算機系統就能夠充分滿足中小農業企業的相關需求。中小農業企業人事管理系統的功能主要包括人力資源的合理分配，人力資源檔案的合理管理，人力資源工資薪酬的合理計算等等。第四，中小農業企業固定資產管理信息系統。該項系統掌握在中小農業企業高層管理者手中，利用計算機系統實現企業固定資產的綜合管理，實現對中小農業企業固定資產的錄入，檢查，維護，統計等功能。
